Protein ZmC2H1 | |
---|---|
Information | |
TF Name: | ZmC2H1 |
Species: | Maize |
TF Family: | C2H2 |
Gene Name(Synonym): | C2H1 |
Uniprot ID: | B4FMK1 |
ZmC2H1 is a protein in the C2H2 family.
Overview of domains present in v5 transcripts | ||
---|---|---|
PF00096 | PF13894 | |
Zm00001eb353990_T001 | ||
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Zm00001eb353990_T004 | ||
Zm00001eb353990_T005 |
Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
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Secondary Structure Color Code | |
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BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
STRN | beta strand |
TURN_TY1_P | type I turn |
UNDETERMINED | no data available |
Domains Present | |
---|---|
PF00096 |
|
PF00096 |
|
PF13894 |
|
PF00096 |
|
PF13894 |
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PF00096 |
|
PF13894 |
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PF00096 |
|
PF13894 |
|
PF00096 |
|
PF13894 |
|
PF00096 |
|
PF13894 |
|
PF00096 |
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PF13894 |
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PF00096 |
|
PF13894 |
|
PF00096 |
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PF13894 |
|
Hover here to show all domains |
ATTATACTTAGCGGGATCCCGAATT...
ATTATACTTAGCGGGATCCCGAATTTAATAGCCCAACATTACTTGTACAGCCCAACAGCCCAATGCCCCCATGCATGGTGGAACCCTAGAGCTTCACCCCTTTTTAGCACCAGCATTCCGCCGCACGACCTCACTCACCACAGGTGCGGCGGCGCACACTGCTGCACACTGCACTCCCTCCGTCCCGCGTCCCCGTTCGGCGCTCTCGGCACGACCGCCGGTAGCCCGGGACGCACGTCGCACGGCCCCATCCCTCCTAGCGGCCGGTGACGGCACCGGCGGCCCTTTGCTCGGCTGTGCCCAAGCTGCGAGGGCGAGATCTACCCCCGCGTCCGTGCATCTTCGTCAGGCCCTTCTCCGGACGAGCACTCACAGGATGTGTTCTGAAGTTCATGTTGAGGGAGATGCAAGTGTCGGACAGAAGGGTTGCAAGGATATAAGGCGTTACAAATGTGAATTTTGCACAGTTGTCAGGTCAAAGAAATGCCTAATTCAAGCTCACATGGTTGCACATCATAAGGATGAACTTGATAAATCAGAAATATACAACTCAGATGGGGAAAAGATTGTTCATGAGCAGGAACATAGGTGCCAAGAGTGTGGCCGTTGTTTCCAGAAACCAGCTCATCTGAAGCAGCACATGCAAAGTCACTCACATGAGAGACTCTTTATTTGCCCACTGGAAGACTGCCCCTTCAGCTATAAAAGAAAAGATCACTTGAACCGACACATGCTTAAGCATGAGGGCAAATTGTTTAGTTGCACCCTGGATGGTTGTGATATGAGGTTCAGTATGAAGGCAGATATGCAACGGCATGTTAAGGAAATCCATGATAGTAAGAACCCCCATCAATTTGTTTGTAAGGAGGACGGCTGTAACAAGGTTTTCAGGTATTCATCAAAGCTGAAGAAACATGAGGAATCTCATGTTAAATTGGACTATGTGGAGGTAGTGTGCTGTGAGCCAGGTTGCATGAAGATGTTCAGAAATGTTGAATATCTGAGGGCTCATAACCAATCTTGCCATCAGTATGTTCAGTGTGAGATATGTGGAGAAAAGCACCTGAAGAAGAACATCAAGCGGCATCTGCAATCACATGACAAGGTGCCCTCTGATGGAAGGATGAAATGCACTTTTGATGGTTGTGAACACTTCTTTTCCAACAAATCAAATCTGACCAAGCATGTCAAGGCATGCCATGACCAGCTGAAACCTTTCAAGTGCGGAATCGTTGGGTGTGGCAAGGCGTTCACCTACAAGCATGTCAGGGATAACCATGAGACATCTGGTGCTCATGTATACATGGAAGGAGACTTTGAAGAGTTGGATGAGCAGTTGCGTGCCCGGCCAAGAGGTGGTCGGAAGAGGAAAGCATTGACGGTGGAAACACTGACACGCAAGAGGGTGACCATCTCCGGCGAGGCTTCATCCTTGGATGATGGAGTGGAGTATCTTCGCTGGTTGCTATCTGGTGGGGATGATTCAATTGATTGTCAGTAGCCGGCGTCTTTTTGCTATCACCGCTGCTTTGTACATGGGTTAGATTATGTAATGTAAGTTGTTTGGTAGACTACGATGGTGTTCATGACGCGTTTGATATATTGTCAGCAGTATGGTAGTGCAGGGCTCTCATAGTAAAGCTTGCCATTTTTGTTGTATCTTTAACCCACGTGGGTCCAGATGATGTGTTTATTCCTATGTATTTACTTATCTACATGTATCCACATGTGCGACTTTGGCGTTTGTTTGAGATTATAATCTGTTAAAATATGTTGGATTATATAATTTGGGCAGATTATAATTCCAAACAAACACTGACTAATGCTCTATTTGTTTACCC
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